Gli erbari hanno un fondamentale scopo scientifico, ma anche uno storico, documentando infatti spesso piante scomparse per avvenute mutazioni ambientali. La nascita del museo-erbario di Cagliari è legata al sorgere del primo orto botanico, ma la sua ristrutturazione e ordinamento risale agli anni ‘50-’60 di questo secolo. Censito per le sue potenzialità ed il suo patrimonio nell’Index Herbariorum, esso comprende: erbario generale, con circa 30.000 exsiccata di varia provenienza; erbario sardo, con circa 21.000 exsiccata sardi; collezione micologica, Funghi Longobardiae Exsiccati, del Cavara (1891), Herbarium Mycologicum Calaritanum; collezione Cecidotheca Italica, Galle italiane di Trotter e Cecconi (1900 1917); collezione lichenologica e briologica, miscellanee di provenienza varia.